現行台灣所得稅法規定，台灣的「居住者」每年需辦理所得稅結算申報，但在過去對於「居住者」的認定，始終未有明確定義。台灣財政部於2012年9月頒布解釋函令，明確了居住者的認定原則，並且將於2013年1月1日起開始實施。

台灣《所得稅法》現行依住所、居留天數等因素，將所得課徵方式分為結算申報及就源扣繳兩套制度，故在繳納所得稅時，需先對個人的課稅身分進行認定。居住者應採所得稅結算申報制度，在當年度所得減除免稅額及扣除額後，依照累進稅率進行課稅，並依照《所得基本稅額條例》計算基本稅負；非居住者則採就源扣繳制度，將各項所得依照各類所得扣繳率標準，於給付時進行扣繳。

依據《所得稅法》第7條第2項規定，居住者是指在台灣「有住所且經常居住」者，或在台灣沒有住所而於一個課稅年度合計在台待滿183天者。但在過去法令沒有明確對「住所」及「經常居住」定義下，多數形成就個案進行事實認定的情形，而現行實務上又多以在台是否設有戶籍來認定居住事實。即納稅義務人在台設有戶籍，則視為在台有住所且有久住的意思，即符合居住者定義，每年需辦理所得稅結算申報。但對於許多長期居住在海外的華僑及台商而言，其生活重心多已不在台灣，但只要在台灣仍設有戶籍，過去往往仍被視為台灣居住者，而需進行所得稅結算申報，並將海外所得納入最低稅負進行申報，故容易產生課稅爭議。

台灣財政部有鑒於此，於2012年9月頒布解釋函令，對《所得稅法》第7條第2項第1款規定之居住者作出明確的認定原則，規定居住者係為一個課稅年度內在台灣設有戶籍，且符合下列情形之一者：

1、在課稅年度內在台灣居住滿31天。

2、在課稅年度內在台灣居住未滿31天，但其生活及經濟重心在台灣境內者。

對於生活及經濟重心是否在台灣境內，由稽徵機關考慮納稅義務人的家庭、職業及社會關係等因素，參照下列原則進行綜合認定：

1、享有全民健康保險、勞工保險、國民年金保險或農民健康保險等社會福利。

2、配偶或未成年子女居住在台灣境內。

3、在台灣境內經營事業、執行業務、管理財產、受雇提供勞務或擔任董事、監察人或經理人。

4、其他生活情況及經濟利益足資認定生活及經濟重心在台灣境內。

綜上所述，在台居住者適用所得稅結算申報制度，稅率為5%－40%，而非居住者則於取得所得時進行就源扣繳，扣繳稅率則多為20%。此次解釋令頒布的居住者認定原則，對於長期於國外居住的華僑或台商而言，在台灣設有戶籍且居住未滿31天者，特此提醒尚須檢視個人在台灣的各項行為，是否足以證明其生活及經濟重心不在台灣？才可適用就源扣繳方式申報在台所得，否則仍應依照居住者身分，進行所得稅結算申報方式進行課稅。