新舊企業所得稅法在稅前列支標準與扣除方法上有不小差異，以「公益性捐贈支出」為例，過去外資企業的公益捐贈只要符合條件，可以在稅前全額列支，但新稅法則規定不可超過年度利潤總額12%，等於大幅縮減了外資企業的稅前列支額度，使外資企業在公益捐贈上不再享有超國民待遇。

類似新舊稅法稅前扣除的差異還有很多，常見的有以下六項：

一、業務招待費
過去的業務招待費營業是以營業額1500萬及500萬元人民幣為限，採用超額累進法計算稅前可扣除限額，額度內發生的業務招待費才能稅前列支。新法則採用「60%和0.5%何者較低法」為扣除原則，也就是只能按業務招待費實際發生額的60%扣除，並且最高不得超過當年銷售收入的0.5%，換句話說，外資企業至少有40%的業務招待費無法稅前列支。

二、技術開發費
新舊稅法對技術開發費都有加計扣除的優惠，但新法在適用條件上放寬許多。過去，企業當年發生的技術開發費比前一年要實際增長10%以上，才允許按當年技術開發費實際發生額的50%加計扣除。新法取消了上述限制，即使技術開發費增加比例不到10%也能適用。

三、固定資產折舊
固定資產折舊支出在新法中有很大變化，主要表現在折舊年限和淨殘值。最低折舊年限方面，飛機、火車、輪船以外的運輸工具為4年，電子設備為3年，而舊法中上述資產最低折舊年限均為5年。這項規定能給外資企業帶來減輕初始稅負的好處。至於淨殘值方面，舊法明確規定外資企業固定資產淨殘值不可低於原價的10%，新法則把確定淨殘值比例的權利交給了企業本身，由企業根據固定資產的性質和使用情況，合理確定固定資產的預計淨殘值，一經確定即不得變更。

四、廣告費和業務宣傳費
過去對外資企業發生的廣告費和業務宣傳費要如何扣除，並沒有明確規定，只要取得與經營活動相關的合法憑據都可據實列支。但新法則明確規定，廣告費和業務宣傳費支出不可超過當年銷售收入的15%，超過15%的部分准予在以後納稅年度中扣除。

五、職工教育經費
新法中，為了鼓勵企業加大培訓力度，對企業發生的職工教育經費支出，只要不超過工資薪金總額的2.5%都准予扣除，比起舊法所准予扣除的限額提升了1%。但要注意新法強調了「實際發生」原則，同時當年度發生的職工教育經費支出如果超標，超標部分可以無限期結轉在以後年度中扣除，與以前的規定大不相同。

六、失業、工傷、生育保險
按照舊法規定，外資企業可稅前直接列支的保險基金僅限於養老保險、醫療保險及住房公積金，其他如失業、工傷、生育保險，則受工資薪金總額14%比例的限制。新法則擴大了扣除範圍，將失業、工傷、生育保險都納入可直接稅前列支的保險基金範圍內，為企業福利費額度留下了更多可用空間。