揭開兩岸租稅協定對台商稅務規劃的影響
台灣現行稅法已比過去台商前往投資大陸時更加嚴謹，台灣個人海外所得稅自2010年開始納入最低稅負，加上尚未生效的兩岸租稅協議及反避稅條款，未來進行投資架構重組或大陸子公司利潤分配時就需在台申報課稅，整體繳納的稅負最終是依台灣的稅率計算，因此台商需理解兩岸租稅協議的概念是讓課稅權歸屬台灣，原本在大陸繳納的稅負轉移由台灣課徵，不因協議的租稅優惠而變少。
近日媒體熱議的兩岸租稅協定，有兩大迷思值得台商探討：
1、關於改變大陸控股結構會被課稅問題
目前大多數從台灣投資大陸的控股架構，都是台灣投資第三地境外公司，第三地境外公司再投資大陸的三層甚至四層結構，未來如果兩岸簽訂租稅協定，允許台灣比照香港，利潤匯出所得稅也是5％，那對依今年大陸國家稅務局601號文件，在台灣有實質經營，也就是對那些母公司在台灣的台商來說，將會取消台灣與大陸間的多層境外公司，直接形成台灣投資大陸的單一架構。（注釋1：兩岸租稅協議已於2015年簽署，尚須經台灣立法院審查通過後正式生效，租稅協議考量台商多以第三地區公司投資大陸，特別納入第三地區公司的實際管理處所在台灣者，也可適用租稅協議中的減免優惠。）
在大陸境內進行上述股東變更，表面上股東是由原境外母公司改成台灣母公司，依今年引起很多爭議的59號文來看，是一種股權轉讓行為，但由於最終股東沒變，也沒有股東從這過程中獲利，且從59號文公布後，各地稅務局對2008年起的企業股權變動逐一清查，也只有股權發生真實變化，就是最終股東真的改變，才會要繳納當時淨資產和註冊資本間，稅率為10％的股權交易所得稅，只要最終的台灣母公司股東地位及股權比例都不變，按目前大陸稅務局執法情況來看，課稅機率極小。
2、關於利潤從大陸匯出要繳交10％或5％所得稅問題
利潤從大陸匯出前要先繳交所得稅，到底是10％還是5％的稅率，嚴格來講對台商影響不大，不論台灣母公司採直接或間接投資大陸，利潤從大陸匯出境外繳交的所得稅，由於納稅主體是台灣母公司，大陸子公司只是代扣代繳，這些稅回到台灣都可以抵扣，另外無根台商股東為台灣個人，在個人海外所得稅尚未課徵，加上台灣個人直接投資大陸取得的利潤分配視為台灣所得課稅下，整體繳納的稅負不會因為匯出稅率不同而改變。（注釋2：台灣稅務居民自2010年1月1日起取得之海外所得應計入基本所得額，納入台灣個人最低稅負制的課稅範圍。）
無根台商的個人股東最該關心的是和兩岸租稅協議無關，但明年將實施的海外所得課稅，無根台商從大陸把利潤匯出境外，要先繳交利潤匯出所得稅，到了境外母公司，再分配給台灣居民股東，就必須依台灣居民海外所得課稅（稅率20％）新規定納稅。
如果是從台灣隔幾層境外公司投資大陸，就算在大陸繳完利潤匯出所得稅，利潤匯進台灣後，依目前規定還要再課25％的台灣營利事業所得稅。這部分不改變，即使透過兩岸租稅協定，讓利潤直接匯回台灣母公司前的利潤匯出稅率是5％，也徒勞無功，因為要重覆課稅，台商還是不會把利潤匯回台灣。（注釋3：台灣營利事業所得稅率自2018年起調整為20％。）
還有一種情況就是目前外籍個人投資大陸，利潤匯出所得稅稅率是零，這是很詭異的現象，但情況確實存在，加上稅法也還未改變，有很多台商紛紛把大陸投資的境外股東，由境外公司改成老闆自己個人的名字。
這種作法短暫避掉利潤匯出所得稅是5％還是10％的問題，但依台灣稅法來看，來源於大陸的利潤不是視為境外收入，應該視同與台灣境內收入，進行合併申報，如此一來海外所得的稅率為20％，台灣境內個人所得稅稅率最高到40％，合併申報的台灣個人所得稅比海外所得稅還要划不來。