兩稅合一後台商稅務規劃重點
《企業所得稅法（2018年修正）》已無針對外商投資企業的優惠政策，以出口業務為主的台商應把稅務規劃的重點放在貿易方式的選擇上，例如何種價格採購保稅材料？何種價格採購非保稅材料？何種海關特殊監管區域可以取得出口退稅？企業需根據產品的退稅率、出口收入、保稅材料採購金額、材料對應的進項稅額、報關物流費用等綜合進行評估，通過測算選擇對企業最有利的貿易方式，而不是一成不變根據客戶的要求選擇來料加工、進料加工或深加工結轉等。
很多台商認為「兩稅合一」就是加稅，其實不然，在大陸目前的15％、24％、33％三種企業所得稅稅率中，台商製造業最多的是24％稅率，只有少部分服務貿易業是33％，或是設於經濟特區（海南、珠海、廈門、汕頭、深圳）、上海浦東新區、國家級開發區或高新技術開發區中的高新技術企業，這些製造業才有可能享受15％的低稅率。
關鍵是24％和15％稅率並沒有包含3％的地方所得稅稅率，換句話說，對24％稅率的台商來說，實質稅率應為27％（實務中有些地方政府會免去3％的地方所得稅），雖然2008年1月1日起的稅率是25％，但和現在的27％稅率比起來，兩稅合一後反而還降了2％的稅率。
大陸企業所得稅率調為與台灣營利事業所得稅都是25％（注釋2：2010年台灣版「兩稅合一」實施，營利事業所得稅稅率從25％調整到17％，至2018年再度調整到20％），已成定局，未來五年內，台商的稅收優惠待遇逐步減少到零（注釋3：《企業所得稅法（2018年修正）》已無針對外商投資企業的優惠政策）。台商在大陸的稅務規劃重點，勢必要從過去引用外資企業所得稅法各項優惠政策，改為透過交易結構達到企業所得稅與增值稅的最大稅收利益，兩稅合一後的稅務焦點將會是交易結構，不再是稅法本身。
「交易結構」就是一個企業的物流、錢流、發票流，其中又以物流最為關鍵。透過不同進貨（原物料、半成品、零配件…）及發貨（產成品）路徑，會衍生出完全不同的稅務後果，特別是物流過程中，不同區域所造成的不同稅務政策，更是台商須謹慎小心的地方，一個錯誤的交易結構會造成巨大的稅收損失。
交易結構主要有兩個重點：
1、選對貿易模式
對出口型台商到底是用來料、進料還是一般貿易，會嚴重影響到最後獲得出口退稅金額的大小。有不少台商會在大陸境內採購料件，對這種部分保稅進口，部分大陸採購的企業來說，一旦選擇「來料加工」模式，將會陷入來料模式所謂「免稅不退稅」的問題，導致大陸境內採購發生的增值稅完全無法退稅，造成上述所說的稅收損失。
到底要如何選擇貿易模式？該如何在進項稅、進項稅轉出〔（出口離岸價－保稅進口金額）×徵退稅率之差〕、出口產品利潤高低等要素間進行判斷，到底是要先買國內料件，還是進口保稅料件等，都會直接影響最後能取得的出口退稅，要透過出口退稅省下增值稅，選對交易結構是唯一的方法。
2、充分利用物流園區、出口加工區、保稅區間的稅收重點
貨物要真實離境才能辦出口退稅，例外的是貨物進到物流園區和出口加工區也視同離境，可以申請出口退稅，但保稅區就不行，貨物從境內直接進到保稅區還是視同內銷，無法辦理出口退稅。（注釋4：目前除保稅物流園區、出口加工區外，根據大陸財政部、國家稅務總局《關於出口貨物勞務增值稅和消費稅政策的通知》（財稅〔2012〕39號）規定，區外企業出口至保稅港區、綜合保稅區、珠澳跨境工業區（珠海園區）、中哈霍爾果斯國際邊境合作中心、保稅物流中心（B型）的貨物也可以辦理出口退稅。）
如何依自己客戶的需要，決定物流的路徑，會牽涉到出口退稅、外匯收支及企業所得稅，台商有無利用物流園區避免直接轉廠（深加工結轉）無法退稅的損失，有無利用轉投資成立於外高橋物流園區貿易公司的模式，進行企業所得稅規劃，及降低被認定移轉定價的風險，都會直接反映在公司的稅務風險及稅收利益上。