利用陸資來台規定解決費用分攤老問題
大陸台資企業為解決境外的研發、業務等費用，支付權利金不僅需代扣代繳稅款，關聯交易移轉利潤也存在稅務風險。台灣放開陸資來台後，大陸台資企業可在台灣設立子公司、分公司、辦事處，然後將台灣母公司的員工、資產移往新設機構，這種利用投資結構解決兩岸費用分攤的作法，首先可以降低關聯交易的稅務風險或代扣代繳的稅務成本；其次可以為台資企業在大陸上市提前做好投資架構調整規劃，解決了上市主體的獨立性問題。
台灣官方7月1日起允許陸資來台投資，所謂「陸資」，應參照之前專欄分析，區分為大陸內資企業（國營企業、民營企業）、大陸外商投資企業（歐、美、日外商獨資企業、中外合資企業），及大陸台資企業三大類型。
一般人都將陸資來台理解為大陸內資企業到台灣投資，忽略了大陸外商投資企業，特別是大陸台資企業也屬於陸資定義範圍，也想利用此次開放陸資來台新規定，進一步改變過去的台灣—境外公司—大陸公司三層投資結構，形成新的台灣—境外公司—大陸公司—台灣子公司四層全新架構。
大陸台資企業回台投資，是指以大陸公司主體為母公司，到台灣設立子公司，目前許多台商生產基地都在大陸，但為了財務、研發或業務目的，在台灣編制龐大的人員，或是在台灣使用大量的固定資產設備，為了維持上述開銷及相關費用，不得不透過移轉定價，或是權利金匯回台灣母公司方式，將部分利潤保留在台灣。
問題是，前者面臨大陸不斷嚴查移轉定價的關聯交易稅務風險；後者要繳納15％的稅率（所得稅10％、營業稅5％，但營業稅有可能可以免繳）外，還面臨各地稅務局要求權利金匯出不得超出營業額一定比例的限制，蘇州地區一般不鼓勵權利金匯出超出營業額的5％到7％。（注釋1：「營改增」後，台商向境外支付特許權使用費時，除要代扣代繳10％的企業所得稅外，還要繳納6％的增值稅。）
台商可利用大陸公司回台設立子公司解決上述問題，至於台灣子公司的法人形式可以是研發機構或其他性質公司，然後將台灣員工移往子公司聘用，讓薪資等費用發生在子公司身上，再讓子公司承租原先台灣母公司的各項固定資產，簡單說，就是要讓台灣子公司的費用透過每年審計，最終合併回大陸公司報表上，讓大陸公司真實反映出該有的淨利潤率，避免過去台灣費用無法在大陸報表上認列的窘境。
但這種利用投資結構解決兩岸費用分攤的作法，還有幾個重點要注意：
1、大陸官方目前已允許企業投資台灣，台商可從大陸直接出資到台灣子公司，或是以固定計算公式，由大陸公司支付台灣子公司權利金、技術服務費或勞務費等，形成台灣子公司的營業收入。當然，台灣子公司最終要保留多少利潤，要看各公司的規劃。
2、如果是台灣上市上櫃公司，這種以大陸回台灣設立子公司的作法，對原台灣母公司的合併報表沒有任何影響，只要讓營收不透過台灣母公司關聯交易，改採與客戶真實交易，還能再降低大陸關聯交易稅務風險。
由於大陸稅務環境變化，台商未來在大陸的關聯交易業務模式，勢必無法被大陸稅務局接受，可以這麼說，台灣上市上櫃公司往香港、新加坡資本市場模式靠攏，轉型走向純控股公司，也就是只認列長期投資收入而沒有主營業務收入，是個必然的趨勢。屆時在台灣發生的費用也只能循回台灣設立子公司、再把費用合併回大陸公司的架構去處理。